Fue en el año 1949 cuando surgió la idea de formar en todo el país la Segunda División, que sería también de ascenso. Querétaro fue de los equipos elegidos, Alfonso Pachín Niembro, presidente de la Asociación Queretana de Futbol recibió la invitación por parte de la Federación Mexicana de Futbol.
Pachín Niembro habló con Raúl Ayala, representante de Querétaro ante la Federación, y entre ambos decidieron afrontar la proeza aunque no contaban con los recursos monetarios, pero la oportunidad no era para desaprovecharse y decidieron que el campeón de la liga amateur de la ciudad representara a Querétaro en la Segunda División para ser de los fundadores de la Segunda División junto con el Irapuato, Zacatepec, Toluca, Morelia y La Piedad.
La fundación oficial del Querétaro se dio el 8 de julio de 1950. El equipo recibiría el mote de los Gallos Blancos a propuesta del Lic. Herrera Pozas. Ese equipo se metió de lleno en el corazón de los aficionados, aunque para llegar a Primera División tardaría cuarenta años.
El Querétaro llegó al Máximo Circuito de la mano de José Antonio García, quiencompró la franquicia del Tampico Madero y la puso en el Estadio La Corregidora para la Temporada 1990-91. Este equipo fue vendido en diciembre de 1991 a los hermanos Vázquez Mellado, con quienes el club descendió a Segunda División en la Temporada 1993-94.
En el año 2002 regresó el futbol de Primera División a la ciudad de Querétaro, ya que la franquicia de los Reboceros de La Piedad se convirtió en Gallos Blancos de Querétaro. El equipo jugó en el Estadio La Corregidora de Querétaro por dos años, ya que en 2004, la Federación Mexicana de Futbol tomó la decisión de reducir el número de equipos en la Primera División, desprendiéndose de losqueretanos y el Irapuato.
De nuevo llegaría otro intento, Querétaro compró una franquicia de Primera División A, la del Zacatepec. En el año 2005, los Gallos Blancos de Querétaro ganaron el torneo Clausura de la Primera A y jugaron la Final del Ascenso contra San Luis, Querétaro cayó por marcador global de 3-2 y se quedó a la orilla. No pudo volver al Máximo Circuito del futbol nacional.
Al siguiente año, el 2006, Querétaro tuvo su revancha, nuevamente fue campeón del torneo Clausura de la Primera División A y volvieron a jugar la final de ascenso, pero en esa ocasión el resultado fue diferente, Querétaro goleó a Puebla con marcador global de 5-1. Volvió a la Primera División.
En el Torneo Clausura 2007, Querétaro perdió la categoría tras perder el último partido de la Liga contra Atlas, aunado a la victoria de Santos Laguna, su más próximo rival en el descenso, ante Cruz Azul. Los Gallos Blancos descendieron.
Todo cambió en el Apertura 2008, al obtener la mayor cantidad de puntos que ha conseguido desde su retorno al Circuito de Ascenso: 33 unidades. Se colocaron como tercer lugar general y primero de su grupo. Ya en la fase final, dejaron fuera a Correcaminos en los Cuartos de Final y a los Xoloitzcuintles de Tijuana en las Semifinales, para coronarse campeones al vencer al Irapuato en la final por dos goles por cero. Tenían medio boleto.
Para el Torneo de Clausura 2009, Mérida fue Campeón, por lo que tuvo que medirse con los Gallos en la Final por el Ascenso. En un par de encuentros, Querétaro logró el Ascenso en penales. En la ida, efectuada en Querétaro, los Gallos vencieron 2-1. En Mérida, los Venados empataron el global. Los tiempos extras se fueron sin anotaciones y, en los cobros desde los once pasos, los Gallos lograron la hazaña de volver al Máximo Circuito.
En la Jornada Cuatro del Torneo Bicentenario 2010, ya en la Primera División, los Gallos Blancos celebraron los 25 años del Estadio Corregidora; inmueble que ha visto partidos mundialista y también ha sentido la lucha permanente de su equipo por convertirse en protagonista del Futbol Mexicano.
Para el Apertura 2010, Ángel Comizzo se hizo cargo del equipo. Pero los resultados de nueva cuenta no saltaron a la vista. Fue hasta el Torneo de Apertura 2011 que los Gallos se meterían a su primera Liguilla de la mano de José Saturnino Cardozo, ahora en su faceta de estratega.
En los Cuartos de Final los Gallos eliminaron a las Chivas Rayadas del Guadalajara con dos goles de Carlos Bueno, los rojiblancos descontarían con tanto de Jorge El "Chatón" Enríquez. En las Semifinales se les cruzarían los Tigres de la UANL que a la postre fueron los campeones de la competencia.
Actualmente el timón del Querétaro para la LIGA MX lo tiene Ignacio Ambriz, quien tienecomo objetivo mantener a los Gallos Blancos en la categoría de honor del Futbol Mexicano y con ello clasificar al conjunto negriazul a la llamada Fiesta Grande del balompié nacional.
Datos.
Nombre oficial: Gallos Balncos por siempre S. A. de C. V.
Fecha de fundación: 8 de julio1950
Director técnico: Ignacio Ambriz
Estadio: La Corregidora
Mote: Gallos Blancos
Palmarés.
Campeón Primera A: Clausura 2005, Clausura 2006 y Apertura 2008
El plantel para el Clausura 2013
Porteros: 1 Liborio Sánchez, 18 Sergio Alejandro García 34 Javier Darío Romo, 20 Antonio Pérez. Defensas: 2 Diego Martínez, 3 Diego Cervantes, 4 Dionicio Escalante, 5 Manuel López, 15 José Daniel Amador, 22 Alfonso Rippa, 27 Christian Alejandro Pérez, 32 Onay Pineda, 33 Patricio Treviño, 35 Oswaldo Henríquez.
Medios: 6 Mitchel Oviedo, 7 Gonzalo Pineda, 8 Diego de la Torre, 10 Edson Omar Vázquez, 11 Jorge Arturo Echavarría, 12 Pablo Daniel Antonio, 13 Luiz Dallisson de Souza, 16 Juan Carlos Mariño, 21 Marco Antonio Jiménez, 23 Manuel Pérez, 25 Antonio Gallardo, 28 Diego Alonso Andrade, 31 Héctor Miguel Gómez.
Delanteros: 9 Luis Ángel Landín, 14 David Izazola, 24 Wilberto Cosme, 29 Julio César Nava, 30 Jonathan de León.
El rival: Querétaro
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