En 1949 la Federación Mexicana de Futbol propuso la participación de un equipo del Estado de Querétaro en la creación de la Segunda División Profesional. El 8 de julio de 1950, se fundó el Querétaro Futbol Club gracias al apoyo de Alfonso ‘Pachín’ Niembro, presidente de la Asociación Queretana de Futbol, mientras que dos años después surgió el mote de Gallos Blancos.
El equipo navegó entre la Segunda y Tercera División, aunque en la temporada 1976-1977 se quedó en la antesala del Máximo Circuito al perder la Final de la Segunda División contra el Atlante. A finales de los 70 desapareció, pero resurgió a mediados de la década de los 80 para pelear por la preferencia de los aficionados con el representativo de la Universidad Autónoma de Querétaro.
El Querétaro F. C. llegó a la Primera División en el inicio de la década de los 90, cuando el empresario capitalino José Antonio García, con la intención de mantener el futbol del Máximo Circuito en la ciudad, tras el descenso del Atlante que se había mudado a sede en la campaña 1989-1990, adquirió la franquicia del Tampico Madero para transformarla en el Querétaro a partir de la temporada 1990-1991.
García Rodríguez contrató al argentino Ricardo La Volpe para dirigir a un plantel integrado en su mayoría por ex jugadores de los Petrojaibos como Mario Zúñiga, el chileno Carlos Fredy Soto, Francisco Fernández, Ricardo Ortega, así como ex integrantes de los Potros de Hierro como Rubén Omar Romano, Guadalupe Cruz, Miguel Herrera, Sergio Bueno, entre otros.
El debut en el campeonato de Liga del conjunto queretano ocurrió el 29 de septiembre de 1990 con una derrota por 2-1 ante el Puebla en el Estadio Cuauhtémoc; el autor del primer gol del equipo en el Máximo Circuito fue José de Jesús Mendizábal, quien marcó al minuto 12 del duelo contra los Camoteros. La primera victoria del Querétaro ocurrió el 7 de octubre de 1990 al vencer por 3-1 al Monterrey en el Estadio La Corregidora.
La campaña de debut del Querétaro fue bastante irregular al terminar en el antepenúltimo lugar con 30 puntos sólo por arriba del Santos Laguna y del descendido Irapuato. Para la temporada siguiente, con el regreso del Atlante a Primera División, José Antonio García mandó al cuadro azulgrana al estratega Ricardo La Volpe así como a Romano, Cruz, Herrera, Wilson Graniolati, además no pudo retener al uruguayo Jorge Cabrera y el goleador Sergio Almaguer, una situación que dejó al equipo disminuido.
Además, a mitad de esa temporada 1991-1992, García Rodríguez vendió el equipo a los hermanos Vázquez Mellado, quienes tomaron la decisión de modificar la camiseta de color celeste a una de rayas azules y negras que recordaban al desaparecido Atletas Campesinos, pero su principal apuesta fue contratar como entrenador a Tomás Boy, quien había salvado a esta misma franquicia del descenso dos años antes cuando jugaba como Tampico Madero.
El ‘Jefe’ Boy hizo un buen trabajo al superar en la pelea por el no descenso a las Cobras de Ciudad Juárez; sin embargo, Tomás no pudo repetir los buenos resultados a la campaña siguiente, pese a que en el equipo se quedó el goleador Felipe del Ángel Malibrán, y llegaron refuerzos como el uruguayo Santiago Ostoloza, así como los delanteros Marco Antonio Ruiz y Eduardo de la Torre, ex del Guadalajara.
En la temporada 1993-1994, el Querétaro arrancó bajo el mando de Rubén Maturano, pero al conseguir sólo un punto en las primeras cuatro jornadas, la directiva determinó cesarlo y ofrecerle la dirección técnica a Carlos de los Cobos, quien decidió retirarse como jugador del equipo para iniciar como entrenador, pese a la complicada situación en la tabla porcentual. La escuadra queretana dio pelea hasta la última jornada para lograr la permanencia en la Primera División, pero no pudo lograrla al perder como visitante contra los Pumas, quedándose a un punto de los Leones Negros de la Universidad de Guadalajara. El descenso fue un duro golpe para la franquicia, pues se alejó dos categorías del Máximo Circuito, ya que no pudo incorporarse a la recién creada Primera A, circuito que se integró por invitación a los equipos.
Debido a los problemas económicos el Gobierno del Estado se quedó con el equipo, que compitió en la Segunda División de 1994 a 2001, hasta que un grupo de empresarios jaliscienses formó una Promotora que adquirió la franquicia del Yucatán para que el Querétaro compitiera en la Primera A.
La presentación del Querétaro en esa división fue mejor de lo pensado al terminar el equipo como líder general en el Invierno 2001, aunque no pudo coronar la buena campaña al caer en Semifinales ante el San Luis, una eliminación que provocó una fuerte rivalidad con el equipo potosino. Sin embargo, la franquicia regresó al Máximo Circuito en el Apertura 2002, cuando la Promotora, que también era propietaria de La Piedad hizo una mudanza de equipos.
Los Gallos Blancos regresaron con más pena que gloria a la Primera División, pues en el Apertura 2003 registraron una de las peores campañas en el Máximo Circuito al sumar sólo siete puntos y sufrir 14 derrotas en 19 partidos. Los emplumados eludieron el descenso en el Clausura 2004, pero la Federación Mexicana de Futbol decidió reducir el número de equipos en la categoría de honor, por lo que una de las dos franquicias que compró para este propósito fue la del Querétaro.
Cuando parecía que el equipo desaparecería, el empresario Juan Antonio Hernández trasladó a los Leones de Morelos (anteriormente Zacatepec) para jugar como Querétaro en la Primera A. El equipo fue un protagonista al punto de conquistar el primer título en la historia de la franquicia luego coronarse en el Clausura 2005, aunque no pudo lograr el regreso al Máximo Circuito al perder la Final por el ascenso ante el San Luis. El equipo cambio de dueño al ser adquirido por el empresario leonés Axel Bulle, quien encontró en Salvador Reyes Jr. al técnico para regresar al Querétaro a la Primera División tras ganar el campeonato de Clausura 2006 y posteriormente la Final por el ascenso contra el Puebla.
Ya en el Máximo Circuito, los Gallos Blancos dieron una buena impresión por su manera de jugar, aunque al no cumplir en el Apertura 2006 con la regla 20/11 perdieron tres puntos, que fueron trascendentales al en la lucha por el no descenso al bajar a Primera A al final del Clausura 2007 tras caer contra el Atlas en la última fecha y ser superados por el Santos Laguna, que a su vez venció al Cruz Azul.
Luego de dos años en la categoría inferior (rebautizada como Liga de Ascenso), ahora con un Patronato como propietario de la franquicia, el Querétaro volvió una vez más a la Primera División, pues como campeón del Apertura 2008 disputó la Final por el ascenso contra el Mérida, rival al que venció en serie de penales en el Estadio Carlos Iturralde.
El conjunto queretano batalló para conseguir resultados en el inicio del Apertura 2009, razón por la cual la directiva prescindió del director técnico Héctor Medrano y en su lugar contrató a Carlos Reinoso, quien le dio al equipo el revulsivo que necesitaba para lograr los puntos necesarios para conseguir la permanencia. Sin embargo, el estratega chileno decidió no continuar al mando del equipo.
Para el Apertura 2010, la directiva apostó como entrenador en Ángel David Comizzo, ex auxiliar técnico de Reinoso, además reforzó al equipo con los uruguayos Sergio Blanco y Sergio Orteman, el bosnio Alen Skoro, Eder Borelli, Gabino Velasco, así como los ex rojiblancos Julio Nava y Jorge Cárdenas, para cubrir las salidas de elementos como Margarito González, Héctor Castro, Germán Villa, Javier Elizondo, Mauro Vila y Julio Laffatigue.
En el Clausura 2011, la directiva queretana, decide darle la responsabilidad del equipo al técnico Gustavo Matosas, en un torneo en el que se juegan la permanencia en el Máximo Circuito, y dejan salir a gente de experiencia como Joaquín Beltrán, Sergio Orteman y su goleador Isaac Romo, y con la llegada de jugadores como Arnhold Rivas, Sergio Ávila, Efraín Cortés, Juan Ocampo, buscarán mantenerse en Primera División.
Para el Apertura 2011, la directiva queretana decide mantener al técnico Gustavo Matosas; y se refuerza con jugadores de Chivas principalmente como Liborio Sánchez, Michel Vázquez, Christian Pérez, Mitchel Oviedo, Juan Ocampo, y el volante Adolfo Bautista, además de Amaury Ponce, Pablo Benells, Israel López y Adrián García Arias.
El equipo está diseñado para buscar la permanencia en el Máximo Circuito, pero sorpresivamente, en la Jornada Cinco, deciden destituir al técnico Matosas y en su lugar nombran al histórico goleador paraguayo, José Saturnino Cardozo, que buscará hacer de Querétaro un equipo ganador.
Datos.
Nombre oficial: Querétaro Futbol Club
Fecha de fundación: 1950
Presidente: Ulises Zurita Reyes
Director técnico: José saturnino Cardozo
Estadio: La Corregidora
Mote: Gallos Blancos
Palmarés.
Campeón Primera A: Clausura 2005, Clausura 2006 y Apertura 2008
El plantel para el Apertura 2011
Porteros: 1 Liborio Sánchez, 34 Javier Darío Romo, 36 Sergio Alejandro García.
Defensas: 19 Adrián García, 16 Sergio Amaury Ponce, 14 Raúl Rico, 15 Manuel López, 4 Diego García, 3 Juan Ocampo, 27 Christian Pérez, 23 Daniel Valdez, 32 Onay Pineda, 2 Efraín Cortés, 31 Maximiliano Arias.
Medios: 5 Israel López, 21 Marco A. Jiménez, 8 Israel Martínez, 17 Hibert Ruiz, 24 Emilio López, 6 Mitchel Oviedo, 11 Jorge Ibarra, 28 Diego Andrade, Daley Yesid Mena.
Delanteros: 7 Adolfo Bautista, 18 Pablo Bonells, 12 Oscar Alanís, 9 Ricardo Michel Vázquez, 26 Francisco Valdés, 20 Carlos Bueno, 22 Franco Niell.
