La historia de los Jaguares de Chiapas es corta, cuando terminó el Verano del 2002, subió a Primera División el Veracruz, pero Irapuato se había traslado al Puerto a jugar, por lo que grupo Pegaso decidió la expansión de las sedes y llevó a uno de sus equipo a la Selva Lancandona con el nombre de Jaguares de Chiapas, teniendo como sede el Estadio Víctor Manuel Reyna.
En el Apertura 2002 fue el debut de Chiapas en el máximo circuito, pero su estadio aún no estaba listo por lo que tuvo que ser local su primer encuentro en el Estadio Azul de la ciudad de México ante los Tigres en donde perdieron 1 - 3, el primer gol en la historia del club lo marcó Lucio Filomeno.
Su primer partido en el Víctor Manuel Reyna fue dentro de la jornada tres del Apertura 2002 ante las Chivas Rayadas del Guadalajara, el marcador terminó empatado a un gol.
En el Clausura del 2004, Chiapas vivió un torneo de ensueño y quedó en el primer lugar de la clasificación general, pero en Cuartos de Final fue eliminado por el Cruz Azul.
Para este torneo, los Jaguares de Chiapas contrataron al "Bofo" Bautista en lo que fue una contratación que causó revuelo en la Selva Lancandona, pero que poco ha funcionado ya que los Jaguares están eliminados de la Liga y el "Bofo" solamente ha marcado dos tantos. Bautista arribó a Chiapas, luego de jugar 7 torneos con la casaca de Chivas y ser campeón con el Rebaño, por lo que se espera un buen recibimiento por parte de la afición tapatía.
Datos generales:
Nombre oficial: Jaguares de Chiapas Futbol Club S.A. de C.V.
Fecha de fundación: 27 de junio del 2002
Presidente: Antonio Castañón
Web oficial: http://www.jaguaresdechiapas.com.mx/
Estadio: Víctor Manuel Reyna
Capacidad: 25, 222
Máximo goleador: Salvador Cabañas con 59.
La plantilla:
Porteros:
- 1 Omar Ortiz
- 23 Edgar Hernández
Defensas:
- 2 Christian Armas
- 4 Ismael Fuentes
- 5 Oswaldo Lucas
- 13 Melvin Brown
- 18 Gabriel Palmeros
- 25 Edoardo Isella
- 27 Jesús Gutiérrez
- 28 Eduardo Chávez
- 44 César Saldívar
Medios:
- 6 André Luiz
- 7 Oscar Razo
- 10 Lenilson Batista
- 15 Felipe Ayala
- 16 Daniel Silva
- 17 Alejandro Corona
- 19 Oscar Rojas
- 20 Jorge Manrique
- 21 Miguel Gómez
- 26 Gilberto Mora
Delanteros:
- 1 Adolfo Bautista
- 8 Javier Cámpora
- 11 Alejandro Vela
- 22 José Rivera
- 36 Mario Gallegos
Director Técnico:
René Isidoro García
